Wie können Antibiotika in Bakterien eindringen? Wie interagieren Proteine miteinander? Und wie können solche biologische Prozesse mit modernen Computersimulationen entschlüsselt werden? Antworten auf diese Fragen liefert unter anderem das Martini-Kraftfeld – eine leistungsstarke Simulationsmethode in der Erforschung (bio)molekularer Systeme.

Am 13. und 14. Februar 2025 findet am Heidelberger Institut für Theoretische Studien (HITS) das Main-Neckar Martini User Meeting 2025 statt. Die Veranstaltung bringt führende Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler sowie Nachwuchsforschende zusammen, um sich über aktuelle Entwicklungen und Anwendungen des Martini-Kraftfelds in der molekularen Simulation auszutauschen.

Einer der Organisatoren des Workshops ist FIAS Fellow Dr. Sebastian Thallmair. Das Programm umfasst Fachvorträge von führenden Entwicklern sowie aktuelle Anwendungsbeispiele, die Einblicke in die neuesten Fortschritte und Möglichkeiten des Martini-Kraftfelds bieten.

Was ist Martini?

Das Martini-Kraftfeld ist ein physikbasiertes Modell, das Wissenschaftler:innen hilft, die komplexen Bewegungen und Wechselwirkungen von Molekülen in biologischen Systemen zu simulieren. Dabei handelt es sich um ein sogenanntes „coarse-grained force field“ (dt. etwa grobkörniges Kraftfeld). Statt jedes Atom einzeln zu betrachten, fasst es mehrere Atome zu größeren Einheiten zusammen. Diese Methode reduziert die Komplexität der molekularen Systeme und damit die Rechenlast erheblich. So wird es möglich, größere Systeme über längere Zeiträume zu untersuchen – etwas, das mit detaillierteren Modellen oft nicht praktikabel wäre. Martini wird beispielsweise genutzt, um zu verstehen, wie Medikamente durch die Zellmembran kommen oder wie Proteine miteinander interagieren. Kürzlich wurde die erste Martini-Simulation einer minimalen Zelle vorgestellt.

Das Martini-Kraftfeld wird von der Martini Force Field Initiative, einer internationalen Kooperation von Forschenden, entwickelt und kontinuierlich weiter verbessert. Der Workshop richtet sich an Wissenschaftler:innen in der Main-Neckar Region, die ihre Kenntnisse vertiefen, neue Anwendungsgebiete erkunden und sich mit der internationalen Forschungscommunity vernetzen möchten. Zudem bietet die Veranstaltung eine Plattform, um gemeinsame Interessen und Herausforderungen zu identifizieren und so Synergien in der Region gezielt zu nutzen. 

Weitere Informationen:

Weitere Informationen zur Veranstaltung finden Sie auf der offiziellen Workshop-Website:

Main-Neckar Martini User Meeting 2025

Bild: Vergleich einer atomistischen und grobkörnigen Martini Darstellung von DNA. In der Martini-Repräsentation Gruppen von Atomen zusammengefasst, so können (bio)molekulare Systeme schneller und effektiver simuliert werden. Bildrechte: Martini Force Field Initiative